混凝土生物破壞與海底隧道微生物群落,和應(yīng)對(duì)的科技進(jìn)展

文 |黛月白
編輯 | 黛月白
引言
近年來(lái),海底隧道建設(shè)成為了現(xiàn)代交通發(fā)展的重要組成部分,隨著時(shí)間的推移,一些海底隧道的鋼筋噴射混凝土遭受了惡化現(xiàn)象,這引起了研究人員的關(guān)注,更加令人驚訝的是,研究發(fā)現(xiàn)這些惡化的混凝土內(nèi),蘊(yùn)藏著各種不同的微生物群落。

混凝土生物破壞
混凝土的生物破壞,是由微生物的代謝活動(dòng)引起的,包括細(xì)菌、古菌、真菌和藻類,它導(dǎo)致了混凝土結(jié)構(gòu)和功能的不良變化,開(kāi)裂、剝落、凹坑和混凝土基質(zhì)中化合物的溶出,微生物需要在混凝土表面定居并形成生物膜,這個(gè)過(guò)程被稱為生物污垢。
生物膜提供了多種優(yōu)勢(shì),易于獲取營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),并對(duì)極端環(huán)境和侵蝕性化合物具有抵抗力。
在混凝土表面形成的生物膜中,微生物細(xì)胞,被嵌入在自產(chǎn)生的胞外聚合物物質(zhì)中,生物膜具有高度水化和開(kāi)放的結(jié)構(gòu),其中不同微生物群落的菌落之間有空隙,形成微環(huán)境的梯度。

混凝土表面的高粗糙度、孔隙和微裂紋,為生物污垢的形成提供了有利條件,混凝土的pH值在施工后通常較高,對(duì)微生物的定居具有一定的免疫性,但當(dāng)pH值降低到一定程度時(shí),生物污垢才會(huì)形成,釋放出的生物酸進(jìn)一步降低了混凝土的pH值,最終溶解水泥糊漿基質(zhì)。
僅靠生物酸無(wú)法完全解釋混凝土的全面破壞,更多是由于持續(xù)進(jìn)行的微生物相互作用的影響,降低的pH值還促進(jìn)了鋼筋和纖維的腐蝕,生物膜中的胞外聚合物,進(jìn)一步加速了鋼筋的腐蝕,其中含有負(fù)電荷,促進(jìn)與金屬的離子和靜電結(jié)合,產(chǎn)生了電偶反應(yīng)。

微生物的活動(dòng)導(dǎo)致了混凝土的持續(xù)破壞,混凝土的生物破壞是一個(gè)復(fù)雜的過(guò)程,不僅涉及生物酸的作用,還包括微生物相互作用和鋼筋腐蝕多個(gè)因素,海底隧道等重要建筑物,科研人員需要采取適當(dāng)?shù)姆雷o(hù)措施,以延緩混凝土的生物破壞過(guò)程,確保結(jié)構(gòu)的安全和可持續(xù)發(fā)展。

奧斯陸峽灣海底隧道的微生物群落
研究人員在挪威德羅巴克附近的奧斯陸峽灣海底隧道,進(jìn)行了采樣,這個(gè)隧道長(zhǎng)7,306米,寬11.5米,最大深度為海平面以下134米,巖體主要由花崗片麻巖和偉晶巖組成,其中的節(jié)理和斷層帶含有黏土礦物質(zhì)。
采樣是在三個(gè)不同的隧道位置進(jìn)行的,主隧道、泵站和奧斯陸峽灣試驗(yàn)場(chǎng)地,代表兩種不同的混凝土基材。主隧道和泵站的混凝土噴涂于1999年,用作永久巖體支護(hù)。這些混凝土采用了一種快速硬化水泥,水膠比為0.42。
膠凝劑含量約為514 kg/m^3,添加了5%硅灰,并添加了鋼纖維增強(qiáng)和減水劑。根據(jù)混凝土標(biāo)準(zhǔn)NS EN 206,這些混凝土屬于耐久性等級(jí)M45和強(qiáng)度等級(jí)B45。硫酸鋁被用作凝結(jié)促進(jìn)劑。

奧斯陸峽灣試驗(yàn)場(chǎng)上的混凝土耐久性試驗(yàn)始于2010年3月,不久后就發(fā)現(xiàn)了微生物生物膜,試驗(yàn)場(chǎng)的混凝土基于CEM II/AV 42,5 R,采用不同的配比制備,生物膜采樣站點(diǎn)位于水膠比為0.43、4%硅灰、減水劑。
鋼纖維和聚丙烯纖維制成的噴涂混凝土上,同樣使用硫酸鋁作為凝結(jié)促進(jìn)劑,這種混凝土與其他兩個(gè)位置的混凝土相比,對(duì)應(yīng)于M45和B45,使用飛灰水泥制成的混凝土,被認(rèn)為比基于CEM I的混凝土更耐久。
在評(píng)估水泥糊劑降解和鋼纖維腐蝕的風(fēng)險(xiǎn)時(shí),使用了NS EN 206的暴露等級(jí),在所有三個(gè)研究地點(diǎn)和所有混凝土配比中,所使用的等級(jí)為XC2-XC3、XS3和XA3,這些混凝土在這樣的環(huán)境中,被認(rèn)為是耐久的。

需要注意的是,混凝土的標(biāo)準(zhǔn)環(huán)境分類,并未考慮生物膜的影響在泵站中,水的溫度為13°C,在主隧道和測(cè)試點(diǎn)的位置大約為8-9°C,并且在過(guò)去幾年中保持相對(duì)穩(wěn)定,盡管科研人員沒(méi)有測(cè)量與生物膜相關(guān)的水流量,但在所有位置上的主要特征是水的滲透速度較慢。

需要注意的是,從2013年開(kāi)始,泵站的水負(fù)荷在空間和容量上都持續(xù)增加,與此相比,之前的13-14年期間,生物膜主要是由較小區(qū)域中的緩慢滲透水所形成,這段文字描述了對(duì)生物膜樣品和水樣品,進(jìn)行微生物群落分析,以及化學(xué)分析的方法。
采集的生物膜樣品是厚且軟的,使用金屬管取得樣品核心,而薄生物膜則用手術(shù)刀從混凝土上刮下,采樣后,樣品立即在乙醇-干冰混合物中快速冷凍,并在運(yùn)輸過(guò)程中放置在干冰中,并在-80°C下保存,直到進(jìn)行核酸提取。

一部分生物膜樣品還用于化學(xué)分析,水樣品則在無(wú)菌瓶中收集,并在運(yùn)輸?shù)綄?shí)驗(yàn)室期間放置在干冰中,所有水樣品在分析前均經(jīng)過(guò)0.45微米的過(guò)濾,用于化學(xué)分析的生物膜樣品在分析前經(jīng)過(guò)均質(zhì)化,并在105°C下干燥。

微波消解后,使用電感耦合等離子體質(zhì)譜儀以及酸按照EPA 3051協(xié)議對(duì)選擇性金屬進(jìn)行定量分析,生物膜的總固體和揮發(fā)性固體,分別根據(jù)APHA 1998標(biāo)準(zhǔn)方法2490 A-D進(jìn)行分析,水中的氯化物、硝酸鹽、銨鹽和硫酸鹽則根據(jù)FINAS認(rèn)可的方法進(jìn)行分析。
這個(gè)工作流程的目標(biāo)是從生物膜樣本中提取DNA,并進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測(cè)序,最后進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,科研人員使用Fast DNA spin kit for soil從500mg的生物膜中提取DNA,這個(gè)試劑盒可以高效地提取DNA,并且適用于土壤樣本。

科研人員使用引物515′F和806 R進(jìn)行PCR擴(kuò)增16S rRNA基因的V4區(qū)域,這一區(qū)域可以涵蓋細(xì)菌和古菌的序列,以便進(jìn)行宏基因組分析,這些引物在先前的研究中已經(jīng)被驗(yàn)證為有效。
PCR擴(kuò)增后,科研人員對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行純化和歸一化處理,以準(zhǔn)備測(cè)序,科研人員使用Illumina MiSeq和MiSeq試劑盒v2進(jìn)行測(cè)序,Illumina MiSeq是一種高通量測(cè)序平臺(tái),可以產(chǎn)生大量高質(zhì)量的DNA序列數(shù)據(jù)。
測(cè)序完成后,科研人員使用USEARCH v.10進(jìn)行序列處理和篩選,科研人員使用MiDAS篩選數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)序列進(jìn)行分類,這樣可以將不同的序列與已知的分類進(jìn)行對(duì)比,以確定它們屬于哪些細(xì)菌或古菌。

科研人員對(duì)分類的序列變異體,在這個(gè)研究中,科研人員使用了三個(gè)R包來(lái)進(jìn)行多元統(tǒng)計(jì)學(xué)、多樣性和空模型計(jì)算,以及數(shù)據(jù)可視化,科研人員使用配對(duì)Sorensen和Bray-Curtis差異,來(lái)估計(jì)樣本間的β多樣性,并使用主坐標(biāo)分析將樣本可視化。

科研人員使用置換多元方差分析,來(lái)檢驗(yàn)樣本間β多樣性的差異,在vegan包中,科研人員使用標(biāo)準(zhǔn)化效應(yīng)大小,來(lái)估計(jì)配對(duì)Sorensen差異,以測(cè)試樣本間隨機(jī)組成,科研人員使用保持物種豐富度和物種發(fā)生率的空模型,并使用quasiswap算法進(jìn)行999次模擬的空模型群落。
科研人員使用picante包來(lái)計(jì)算未加權(quán)最近分類指數(shù),并使用“taxa.labels”的空模型,進(jìn)行999次迭代,以測(cè)試密切相關(guān)類群之間的系統(tǒng)發(fā)生聚類,為了探索微生物群落結(jié)構(gòu)與生物膜,以及水的化學(xué)特性之間的關(guān)聯(lián)。

科研人員使用Welch's ANOVA,來(lái)檢驗(yàn)群落豐富度和均勻度的差異,并使用Games-Howell檢驗(yàn)進(jìn)行事后分析,這些分析有助于科研人員理解樣本間的差異和相似性,并從中推斷出關(guān)于微生物群落結(jié)構(gòu)及其與環(huán)境特征之間的關(guān)系。

本實(shí)驗(yàn)使用微傳感器,對(duì)生物膜進(jìn)行原位氧和pH梯度測(cè)量,氧微傳感器和pH微傳感器與參比電極結(jié)合使用,連接到一個(gè)多用途儀表上,并通過(guò)軟件進(jìn)行控制,在每次測(cè)量之前,先使用一個(gè)已使用過(guò)的微傳感器估計(jì)生物膜的深度。
將微傳感器尖端定位在生物膜-水界面上,并在每次測(cè)量之前等待一段時(shí)間進(jìn)行微剖面測(cè)量,實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,根據(jù)制造商的協(xié)議,氧傳感器進(jìn)行了校準(zhǔn),使用100%空氣飽和鹽水地下水在當(dāng)前溫度下進(jìn)行校準(zhǔn),而pH傳感器使用當(dāng)前溫度下的三個(gè)pH緩沖液點(diǎn)進(jìn)行線性校準(zhǔn)。

掃描電子顯微鏡,是一種科學(xué)儀器,用于觀察微小的樣品,在這個(gè)實(shí)驗(yàn)中,科研人員使用了一臺(tái)名為Hitachi S-4800SEM的儀器,配備了能量散射X射線光譜儀,科研人員將未經(jīng)涂層的手選樣品固定在碳膠帶上,并使用這臺(tái)儀器,對(duì)樣品進(jìn)行了化學(xué)點(diǎn)分析。

對(duì)于大多數(shù)元素,分析精度在1-2%之間,但對(duì)于碳和氮元素,精度相對(duì)較低,科研人員還捕捉了樣品的反射電子圖像,以提供更多的信息,科研人員使用了掃描電子顯微鏡和能量散射X射線光譜儀,來(lái)對(duì)未經(jīng)處理的樣品進(jìn)行化學(xué)分析。
這些實(shí)驗(yàn)幫助科研人員了解樣品的化學(xué)成分,并提供了有關(guān)樣品結(jié)構(gòu)和特性的詳細(xì)信息,測(cè)量結(jié)果表示,奧斯陸峽灣海底隧道的鹽水地下水,與海水的化學(xué)成分相似,它們的主要成分是氯化物、鈉和硫酸鹽,濃度較高。

而銨離子、硝酸鹽和溶解有機(jī)碳的濃度較低,科研人員研究了接觸混凝土和生物膜后的水樣,與僅接觸巖體的水樣相比,科研人員發(fā)現(xiàn)鈣、鎂和釩的濃度更高,對(duì)于其他元素,沒(méi)有明顯的差異。
通過(guò)對(duì)生物膜的化學(xué)分析,科研人員發(fā)現(xiàn)橙色生物膜中,含有較高濃度的鐵和鈣,而黑色生物膜中含有較高濃度的錳,科研人員還通過(guò)失重,測(cè)定確定了生物膜中有機(jī)物的含量,結(jié)果顯示大部分生物膜成分是無(wú)機(jī)物。

根據(jù)16S rRNA SVs的分類分析,科研人員發(fā)現(xiàn)變形菌門是生物膜群落的主要成員,占據(jù)了群落的44-49%,除了變形菌門,大部分SVs屬于隱球菌門、古菌門、擬桿菌門和放線菌門,微酸菌門和硝化螺旋菌門,在64個(gè)生物膜樣本中的相對(duì)序列豐度,超過(guò)了總?cè)郝涞?%。
為了更直觀地了解這些結(jié)果,科研人員繪制了一個(gè)箱線圖,展示了生物膜中前15個(gè)主要門的情況,閱讀量采用對(duì)數(shù)刻度顯示,在箱線圖中,粗體垂直線代表中位數(shù),箱體邊界代表25%和75%分位數(shù),排除異常值的水平線代表最小值和最大值,而點(diǎn)表示異常值。

這些分析結(jié)果表明不同的菌門在生物膜群落中,扮演著重要的角色,并且變形菌門是最主要的成員之一,微酸菌門和硝化螺旋菌門,在樣本中的相對(duì)序列豐度也相對(duì)較高,這些信息有助于科研人員更好地了解生物膜的組成,和生態(tài)系統(tǒng)中不同微生物的相對(duì)豐度。
海底隧道鋼筋噴射混凝土中,蘊(yùn)藏的微生物群落,對(duì)于海底隧道的生物破壞,具有重要意義,通過(guò)深入研究和了解這些微生物群落,科研人員可以更好地應(yīng)對(duì),和解決海底隧道鋼筋噴射混凝土的惡化問(wèn)題,保障隧道的結(jié)構(gòu)完整性和使用安全性。

結(jié)語(yǔ)
通過(guò)深入研究和了解微生物的特性和作用機(jī)制,科研人員可以制定合理有效的預(yù)防和控制策略,保障隧道的結(jié)構(gòu)完整性和使用安全性,這需要工程界、學(xué)術(shù)界和政府部門的共同努力與支持,才能在海底隧道建設(shè)和維護(hù)中取得更大的成功。
參考文獻(xiàn)
1. Albertsen M, Karst SM, Ziegler AS, Kirkegaard RH, Nielsen PH. 2015. Back to basics-the influence of DNA extraction and primer choice on phylogenetic analysis of activated sludge communities. PloS One. 10:e0132783 doi: 10.1371/journal.pone.0132783 [Crossref], [PubMed], [Web of Science (R)], [Google Scholar]
2. Bastidas-Arteaga E, Sánchez-Silva M, Chateauneuf A, Silva MR. 2008. Coupled reliability model of biodeterioration, chloride ingress and cracking for reinforced concrete structures. Struct Saf. 30:110–129. doi: 10.1016/j.strusafe.2006.09.001 [Crossref], [Web of Science (R)], [Google Scholar]
3. Battin TJ, Besemer K, Bengtsson MM, Romani AM, Packmann AI. 2016. The ecology and biogeochemistry of stream biofilms. Nat Rev Microbiol. 14:251–263. doi: 10.1038/nrmicro.2016.15 [Crossref], [PubMed], [Web of Science (R)], [Google Scholar]
4. Beech IB, Sunner J. 2004. Biocorrosion: towards understanding interactions between biofilms and metals. Curr Opin Biotechnol. 15:181–186. doi: 10.1016/j.copbio.2004.05.001 [Crossref], [PubMed], [Web of Science (R)], [Google Scholar]
5. Bertron A. 2014. Understanding interactions between cementitious materials and microorganisms: a key to sustainable and safe concrete structures in various context. Mater Struct. 47:1787–1806. doi: 10.1617/s11527-014-0433-1 [Crossref], [Web of Science (R)], [Google Scholar]

